染色质免疫共沉淀技术测序（chip-seq 组蛋白 转录因子）
将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。
LncRNA基因组分析
LncRNA-长链非编码RNA（Long noncoding RNA）是一类长度超过200nt的RNA分子，它们极少具有蛋白编码潜能。
多态性标记开发(SNP 分子鉴定 近等基因系）
高通量开发不同个体间的SNP、InDel标记，实现全基因组均匀覆盖，特别适合近等基因系、单片段代换系中相应片段的鉴定。
基因组目标区域重测序
使用Illumina Genome AnalyzerⅡ对基因组挑选某些特定区域进行测序。节约了测序成本和时间，有助于发现大量个体基因变异、靶向筛选核酸序列等。