活性基蛋白质组学（Activity-Based Protein Profiling, ABPP）是一种以功能为导向的蛋白质组研究技术，能够特异性捕获细胞或组织中处于活性状态的酶类蛋白。ABPP不仅能提供蛋白表达信息，还能反映其真实功能状态，是酶类靶标发现、药物作用机制解析、疾病标志物筛选的关键工具。

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在蛋白质组学不断向精细化与功能化拓展的当下，如何从整体层面解析蛋白质的结构与修饰，成为解析生物功能和疾病机制的关键。Top-Down蛋白质测序作为直接分析完整蛋白质分子的技术路径，近年来在多种复杂生物体系中展现出独特优势，是研究蛋白质异构体和翻译后修饰（PTMs）不可或缺的工具之一。 一、Top-

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免疫学方法如ELISA和Western blot虽然广泛使用，但在特异性、通量和定量准确性方面存在诸多限制。尤其在面对复杂生物样本和低丰度蛋白时，这些方法常常力不从心。因此，研究者亟需一种灵敏度高、重复性强、定量准确的技术，以满足疾病标志物验证、药物靶点研究和多中心临床样本对比等需求。本文主要对PR

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在靶向蛋白质定量研究中，PRM（Parallel Reaction Monitoring）因其出色的特异性与灵敏度，已被广泛应用于疾病标志物验证、药物研发以及机制研究。然而，PRM的有效性不仅取决于质谱设备的先进程度，更依赖于从样本处理到数据解读的全流程质量控制。本文将以样本处理到最终数据解读的完整

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在蛋白质组学研究中，PRM（Parallel Reaction Monitoring）技术因其特异性强、灵敏度高而被广泛应用于生物标志物验证、机制研究与生物药开发等领域。尤其是在高分辨率质谱平台Orbitrap上的应用，使得PRM的定量准确性和重复性达到新的高度。然而，实现真正的精确定量并非仅依赖于

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Parallel Reaction Monitoring（PRM）是基于高分辨率、高质量精度质谱平台的靶向蛋白质定量技术，广泛应用于肿瘤标志物验证、药物靶点确认、信号通路研究等领域。相比选择反应监测（SRM/MRM），PRM 利用 Orbitrap 或 Q-TOF 等高分辨率质谱仪器记录全部碎片离子

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生物标志物（Biomarkers）作为疾病早期诊断、预后评估、治疗监测的重要手段，正成为生物医学研究的热点。而如何从成千上万的蛋白中筛选并验证出具有临床意义的标志物？Parallel Reaction Monitoring（PRM）作为一种高特异性、高通量的靶向蛋白质定量技术，已经成为推动生物标志物

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在蛋白质组学研究中，低丰度蛋白质的精准定量对于疾病早期标志物发现、药物靶点验证以及复杂信号通路解析至关重要。然而，常规数据依赖采集（DDA）方法在面对复杂样本背景和极低丰度目标分子的情况下，往往存在检测灵敏度不足、重现性差的问题。近年来，PRM技术（Parallel Reaction Monitor

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蛋白质组学研究中，如何对感兴趣蛋白进行准确、可重复的定量分析，是疾病机制解析、药物靶点确认及临床转化研究的关键需求。而由于蛋白质复杂性及其表达水平的高度动态范围，直接进行蛋白质层面定量往往面临巨大挑战。因此，多肽层面的定量策略成为主流路径。PRM技术（Parallel Reaction Monito

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蛋白质组学研究与临床转化应用中，低丰度蛋白质的定量检测始终是技术瓶颈。这类蛋白虽然表达水平极低，却往往具有极高的生物学意义，例如炎症因子、细胞因子、转录因子或疾病早期标志物。DDA（Data Dependent Acquisition）模式受限于采集深度和动态范围，难以稳定检测这些低丰度靶标。（Pa

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